Antibiotics conspicuously affect community profiles and richness, but not the density of bacterial cells associated with mucosa in the large and small intestines of mice.

Puhl, N.J., Uwiera, R.R.E., Yanke, L.J., Selinger, L.B., et Inglis, G.D. (2012). « Antibiotics conspicuously affect community profiles and richness, but not the density of bacterial cells associated with mucosa in the large and small intestines of mice. », Anaerobe, 18(1), p. 67-75. doi : 10.1016/j.anaerobe.2011.12.007

Résumé

Nous avons examiné les effets de trois antibiotiques (bacitracine, enrofloxacine et sulfate de néomycine) sur le microbiote entérique associé aux muqueuses et sur les intestins de souris. Les antibiotiques ont causé une distension bien visible des cæca et une augmentation de la longueur de l’ensemble de l’intestin. Nous n’avons toutefois observé aucun changement pathologique associé à l’augmentation de la taille des cæca ou de la longueur de l’intestin. Nous avons observé des réductions évidentes de la richesse des bactéries associées aux muqueuses ainsi que des changements aux profils des communautés dans l’intestin grêle (duodénum, jéjunum proximal, jéjunum moyen, jéjunum distal et iléon) et le gros intestin (cæcum, côlon ascendant et côlon descendant) chez les souris ayant reçu des antibiotiques. Les communautés chez les souris traitées au moyen des antibiotiques étaient dominées par un nombre limité de Bacteroides et d’espèces ressemblant à Clostridium (ex. groupe clostridial XIVa). La richesse des communautés associées aux muqueuses dans l’intestin grêle et le gros intestin a augmenté durant les 14 jours de rétablissement. Cependant, les profils des communautés dans le gros intestin ne sont pas revenus à leur état initial (c.‑à‑d. relativement au témoin). Bien que l’administration d’antibiotiques ait considérablement réduit la richesse bactérienne, les densités des bactéries associées aux muqueuses n’ont pas été réduites en conséquence. Ces données montrent que la bacitracine, l’enrofloxacine et le sulfate de néomycine administrés aux souris pendant 21 jours n’ont pas stérilisé l’intestin, mais qu’ils ont eu un effet considérable et prolongé sur les communautés bactériennes associées aux muqueuses tout le long de l’intestin grêle et du gros intestin.