Cutinolytic esterase activity of bacteria isolated from mixed-plant compost and characterization of a cutinase gene from Pseudomonas pseudoalcaligenes.
Inglis, G.D., Yanke, L.J., et Selinger, L.B. (2011). « Cutinolytic esterase activity of bacteria isolated from mixed-plant compost and characterization of a cutinase gene from Pseudomonas pseudoalcaligenes. », Canadian Journal of Microbiology / Revue canadienne de microbiologie, 57(11), p. 902-913. doi : 10.1139/W11-083
Résumé
L’objectif de l’étude actuelle était d’examiner l’activité estérase cutinolytique (i.e. cutinase) de pseudomonades et de bactéries isolées de compost végétal. Approximativement, 400 isolats représentant 52 taxons récupérés de compost végétal à l’aide d’appâts faits de cuticule ont été évalués, parallèlement à 117 isolats de pseudomonades obtenus d’une collection de culture (i.e. d’habitats non faits de compost). La capacité des isolats à dégrader la cutine synthétique, la polycaprolactone (PCL), a d’abord été mesurée. Les isolats appartenant à 23 taxons recueillis du compost dégradaient la PCL. De même, les isolats de 13 taxons de pseudomonades dégradaient la PCL. Un criblage secondaire a mesuré l’activité estérase induite par la présence de cuticule de pomme à l’aide d’un substrat chromogène, le p-nitrophényl butyrate. Dix-huit isolats représentant quatre taxons (Alcaligenes faecalis, Bacillus licheniformis, Bacillus pumilus et Pseudomonas pseudoalcaligenes) récupérés du compost montraient une activité estérase importante lorsque cultivés en présence de cuticule. Au contraire, aucun isolat de pseudomonades de la collection de culture ne produisait d’activité estérase appréciable. Même si la dégradation de PCL n’était pas corrélée avec l’activité estérase, les isolats incapables de dégrader la PCL ne produisaient pas d’activité estérase mesurable. Le zymogramme a indiqué que les estérases produites par les bactéries du compost avaient une taille de 29 à 47 kDa. Un gène de P. pseudoalcaligenes (cutA) codant une estérase de 302 acides aminés d’une taille théorique de 32 kDa et induite par la cutine a été trouvé. Cette enzyme était unique et elle était étroitement reliée à d’autres lipases bactériennes (≤48 % de similarité).
