Characterization and genetic analysis of bovine αs1-casein i variant.

Lühken, G., Caroli, A.M., Ibeagha-Awemu, E.M., et Erhardt, G. (2009). « Characterization and genetic analysis of bovine αs1-casein i variant. », Animal Genetics, 40(4), p. 479-485. doi : 10.1111/j.1365-2052.2009.01861.x

Résumé

Notre étude visait à déterminer l’origine génétique moléculaire du variant I de la caséine alpha S1 (α_s1) et à mettre au point un test génétique à base d’ADN pour mettre en évidence ce polymorphisme sans qu’il soit nécessaire d’analyser des échantillons de lait. Nous avons séquencé tous les exons et les régions flanquantes des exons du gène α_s1‑casein des échantillons d’ADN provenant de bovins dont le génotype α_s1‑casein (BI, CI, II, CC), avait été déterminé par électrofocalisation des échantillons de lait. Une substitution de nucléotides (A>T) dans l’exon 11 (g.19836A>T) a donné lieu au remplacement du Glu par l’Asp à la position 84 de la protéine mature (p.Glu84Asp) chez laquelle on a constaté une coségrégation parfaite avec le variant α_s1-caséine I dans le lait des animaux de l’étude. Le génotypage par RFLP de 680 échantillons d’ADN de 31 bovins des races Bos taurus, Bos indicus, Bos grunniens, Bison bison et Bison bonasus a révélé une faible fréquence de substitution à la position 84 (Asp) chez les races Bos taurus et Bos indicus. Cette analyse a permis de déterminer que ce variant provenait du variant α_s1-caséineC (p.Glu192Gly). Le séquençage de la région intragénique déterminée par l’intron 8 jusqu’à l’intron 12 a révélé la présence de dix haplotypes, dont deux trouvés uniquement chez Bison bison et un, seulement chez Bison bonasus. Les données existantes sur le complexe du gène de la caséine ont permis de mettre en évidence une association entre l’Asp à la position 84 et la β‑caséine A² ainsi que la κ‑caséine B chez le Bos indicus de la race Banyo Gudali. Ces résultats nous permettent de supposer que le variant α_s1‑caséine I est issu d’une substitution nucléotidique non synonyme dans l’exon 11 du gène et que cette substitution s’est produite chez Bos indicus avant de se retrouver également chez Bos taurus