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Stearoyl-CoA desaturase 1 3′UTR SNPs and their influence on milk fatty acid composition of Canadian Holstein cows.

Kgwatalala, P.M., Ibeagha-Awemu, E.M., Mustafa, A.F., et Zhao, X. (2009). « Stearoyl-CoA desaturase 1 3′UTR SNPs and their influence on milk fatty acid composition of Canadian Holstein cows. », Journal of Animal Breeding and Genetics, 126(5), p. 394-403. doi : 10.1111/j.1439-0388.2008.00796.x

Résumé

La stéaroyl-CoA désaturase 1 (SCD1) catalyse la synthèse de l’acide linoléique conjugué (ALC) et des acides gras monoinsaturés (AGMI) dans la glande mammaire des ruminants. D’importantes différences ont toutefois été signalées dans les teneurs en ALC et en AGMI parmi les animaux d’un même groupe contemporain. Nous avons voulu vérifier si le polymorphisme nucléotidique (SNP) dans les régions 5′ et 3′ non traduites (UTR, pour untranslated regions) du gène de la SCD1 avait un effet sur la production de l’enzyme SCD1 et, par conséquent, sur son activité dans la glande mammaire, ce qui pourrait expliquer certaines des différences constatées dans les teneurs en ALC et en AGMI entre les animaux d’une même race. Nous avons séquencé les régions 5′ et 3′ UTR du gène SCD1 de 46 vaches Holstein et de 35 Jersey à la recherche de SNP. Il n’y en avait aucun dans la région 5′, mais nous en avons trouvé 14 dans la région 3′ UTR. Des analyses plus poussées ont révélé trois structures haplotypiques ou variants régulatoires chez les Holstein (H1, H2 et H3) mais seulement deux, chez les Jersey (H1 et H3). Le variant H1 comprenait un motif IRES. Une étude subséquente sur les profils d’acides gras du lait de 862 vaches Holstein a montré que le variant H1 est associé à des indices élevés de désaturase C10 et C12 et, par conséquent, à des teneurs plus élevées en C10:1 et en C12:1 que le variant H3. Les effets du variant H2 se situaient entre ceux des variants H1 et H3. Le polymorphisme dans la région 3′ UTR du gène SCD1 peut donc expliquer une partie des différences observées dans les teneurs en AGMI du lait des animaux d’une même race.