Genetic diversity and admixture of indigenous cattle from North Ethiopia: Implications of historical introgressions in the gateway region to Africa.

Zerabruk, M., Li, M.H., Kantanen, J., Olsaker, I., Ibeagha-Awemu, E.M., Erhardt, G., et Vangen, O. (2012). « Genetic diversity and admixture of indigenous cattle from North Ethiopia: Implications of historical introgressions in the gateway region to Africa. », Animal Genetics, 43(3), p. 257-266. doi : 10.1111/j.1365-2052.2011.02245.x

Résumé

Nous avons examiné la variation des microsatellites pour déterminer la diversité génétique, la structure démographique et le mélange de races de sept races bovines du nord de l’Éthiopie en combinant plusieurs ensembles de données sur des microsatellites de zébus de l’Inde et de l’Afrique occidentale et de bœufs taurins (Bos taurus) d’Europe, d’Afrique et du Proche‑Orient pour des analyses génétiques. D’après la distribution allélique, nous avons identifié quatre allèles diagnostiques (HEL1 : 123 pb; CSSM66 : 201 pb, BM2113 : 150 pb; ILSTS6 : 285 pb) spécifiques aux bovins taurins du Proche‑Orient. Les résultats de l’analyse des relations génétiques et de la structure démographique ont permis de confirmer la distinction génétique marquée établie auparavant entre bovins taurins et zébus et de mettre en évidence une divergence encore plus nette entre les groupes raciaux biogéographiques tels que les zébus du nord de l’Éthiopie, de l’Inde et de l’Afrique occidentale et les bovins taurins de l’Afrique, de l’Europe et du Proche‑Orient. Nous avons utilisé les allèles diagnostiques pour constituer les groupes biogéographiques et une méthode bayésienne pour déterminer les structures démographiques, ce qui nous a permis d’estimer les influences génétiques des grandes introgressions de l’histoire des bovins du nord de l’Éthiopie. Les races étudiées ont été fortement influencées (> 90 %) par le zébu; viennent ensuite les bovins taurins d’Afrique, d’Europe et du Proche‑Orient. Dans l’ensemble, nous avons constaté une forte variation génétique à l’intérieur des populations de bovins du nord de l’Éthiopie (ex. hétérozygotie observée = 0,659‑0,687), les valeurs mesurées se situant dans la portion supérieure de la plage des valeurs signalées pour les bovins domestiques, ce qui indique qu’ils ont du potentiel pour la sélection génétique, même dans un contexte mondial. Par ailleurs, une différenciation plutôt faible, mais néanmoins significative (F_ST = 1,1 %, P < 0,05) a été constatée à la suite de multiples introgressions et de forts échanges génétiques chez les races du nord de l’Éthiopie.