Assessments of genetic diversity within a world collection of cultivated hexaploid oat (Avena sativa L.) based on qualitative morphological characters.

Diederichsen, A. (2008). « Assessments of genetic diversity within a world collection of cultivated hexaploid oat (Avena sativa L.) based on qualitative morphological characters. », Genetic Resources and Crop Evolution, 55(3), p. 419-440. doi : 10.1007/s10722-007-9249-y

Résumé

Nous avons caractérisé 10 105 spécimens d’avoine cultivée hexaploïde (Avena sativa L. sensu lato) provenant de 85 pays et déposés dans la collection de Ressources phytogénétiques du Canada, à Saskatoon, en Saskatchewan, au Canada. Nous avons réparti ces spécimens en groupes morphologiques génétiquement distincts en nous fondant sur huit caractères indépendants des conditions environnementales (type de panicule, port plus ou moins dressé de la panicule, densité de la panicule, couleur du lemma, arête dorsale du lemma, ligule, grand groupe infraspécifique) et en distinguant 18 états de ces divers caractères. Nous avons ainsi pu comparer la diversité de l’avoine provenant des divers pays, appartenant aux divers groupes infraspécifiques ou appartenant à divers cultivars canadiens enregistrés de 1886 à 2002. Les 10 105 spécimens se répartissaient inégalement en 118 groupes morphologiques. Les 13 groupes les plus fréquents réunissaient 90 % des spécimens et correspondaient exactement aux types les plus fréquents de cultivars canadiens. La plus grande diversité a été observée parmi les avoines provenant de pays qui ont un climat tempéré et disposent de programmes d’amélioration intensifs. Les 10 105 spécimens étudiés comprenaient 8 754 spécimens d’avoine vêtue commune, 183 spécimens d’avoine nue et 1 168 spécimens d’avoine rouge (A. byzantina C. Koch). La plus grande diversité d’avoine rouge se rencontrait en Asie de l’Ouest. Les États Unis peuvent être considérés comme un centre secondaire de diversité pour l’avoine rouge, tandis que le Canada peut constituer un tel centre pour l’avoine nue. La diversité morphologique des cultivars mis en circulation au Canada a augmenté au cours du XXe siècle. Les groupes morphologiques étaient reliés aux groupes taxonomiques infraspécifiques officiellement reconnus au sein de l’A. sativa. Nous discutons enfin des applications possibles de la définition de groupes morphologiques pour le phénotypage d’une grande collection de matériel génétique.